آزمایشگاه مرکزی سال 1382 ابتدا در ساختمان دانشکده علوم زراعی راه اندازی و دوباره در سال 1396به ساختمان دانشکده تولید گیاهی منتقل شد. سال 1405 ساختمان مجزا با نام آزمایشگاه مرکزی ساخته شده است که دستگاهها به آنجا انتقال داده خواهد شد.

آزمایشگاه مرکزی مطابق قوانین دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان محل استقرار دستگاه های مهم وگران­قیمت و زیر نظر معاونت پژوهشی و فناوری دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی مشغول بکار می باشد. اهداف اصلی در جهت ایجاد آزمایشگاه مرکزی شامل :

1-  ارزیابی نیازهای تجهیزاتی آزمایشگاه و برنامه ریزی برای تامین آن­ها

2-  مدیریت نحوه خدمات دهی آزمایشگاهی و تهیه دستورالعمل­های لازم کار در آزمایشگاه

3-  تشکیل بانک اطلاعات آزمایشگاه ها و تجهیزات دانشگاه

4-  مشارکت در تعمیرات تجهیزات آزمایشگاهی دانشگاه

5-  مشارکت در خریدهای متمرکز تجهیزات آزمایشگاهی دانشگاه

6-  مشارکت در اجرای نظام سلامت، ایمنی و بهداشت آزمایشگاه­های دانشگاه

مدیران آزمایشگاه مرکزی از سال 1382 تا کنون به شرح ذیل می باشد:

1- دکترکامبیز مشایخی (دکتری علوم باغبانی)

2- دکتر حسن سلطانلو(دکتری بیوتکنولوژی)

3- دکتر سید اسماعیل رضوی (دکتری اکولوژی کشاورزی)

4- دکتر محمد قربانی (دکتری صنایع غذایی)

5- دکتر سعید زره داران (دکتری علوم دامی)

6-دکتر حسین یوسفی( دکتری چوب و کاغذ)

7- دکترحسن رضایی(دکتری محیط زیست)

کارشناسان آزمایشگاه مرکزی از سال 1382 تا کنون:

1- مهندس مینو رستگار(کارشناس ارشد مهندسی علوم و صنایع غذایی) از سال 1382

2- دکتر ماهرخ شربتخواری (دکتری زراعت) سال 1384 تا 1387

2- دکتر محمد رضا شکوری(دکتری علوم سیاسی) سال1393تا 1404

3- دکتر سید رضا خالقی (دکتری شیلات) از سال 1404

4- دکتر وثیقه میر باقری (دکتری شیلات) از سال 1404